植物基因启动子研究方法
摘要:高等植物基因表达的调控主要发生在转录水平上,启动子是基因转录过程中必不可少的元件。启动子具有独特的结构和功能特点,能够调控基因表达的时间,表达的位置以及表达的产物量,目前已经成为了基因工程研究的关键。植物启动子根据转录模式的不同可分为组成型启动子,组织或器官特异型启动子以及诱导型启动子。植物启动子克隆的方法主要有常规PCR法,启动子捕获法,启动子陷阱技术,以及利用基因文库筛选启动子的方法等。本文对植物启动子的结构、类型和克隆方法做了综述。
关键词:植物; 启动子; 克隆;研究方法
1 引言
为适应复杂多变的生长环境,植物能够根据自身的需求以及外界环境的变化,定时、定位以及定量地表达所需的基因产物。植物基因的表达在DNA水平,转录水平,转录后水平以及翻译水平等各个环节都受到精确的调控,尤其是转录水平上的调控最为关键。转录水平上的调控主要通过一些顺式作用元件,转录因子以及RNA聚合酶的相互作用来实现,在转录水平众多的调控元件中,启动子的作用显得尤为重要。
启动子一般位于基因的上游,是一段能被RNA聚合酶识别并与之结合,从而启动基因转录的一段DNA序列。启动子决定了下游基因转录的特异性、方向性与效率,是转录调控的中心。
2 植物启动子的基本结构
通过对大多数植物基因启动子的分析发现,功能蛋白基因的启动子一般都由转录起始位点,核心启动子区以及上游启动子区等部分组成。核心启动子区是启动子普遍都具有的起始基因转录序列,主要包括转录起始点和TATA框;位于TATA框上游的保守序列称为上游启动子元件或上游激活序列,主要包括CAAT框、GC框以及距离转录起始点更远的上游元件,这些元件与相应的转录因子结合,决定基因转录的特异性和活性。
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