- 文献综述（或调研报告）：
文献综述分为两个部分，第一部分是关于如何创造一个稳定的液滴环境的简叙，第二部分是关于如何对实验结果进行分析。
（一）液滴稳定性探索
创造合适的微液滴体系的前提是这个体系具有稳定性。如果将DNA反应的体系作为水相加入微流道芯片的分散相流道中，那么根据疏水-亲水作用原理，其连续相中需要加入有机油相物质（难溶于水）以保证水相分散于油相中，这个体系的形成需要在油相中添加适量的表面活性剂。
可以通过预先混合油与表面活性剂，在微流控芯片上生成稳定液滴的实验来选出最佳的表面活性剂配比。
（二）实验结果分析
关于实验结果的分析，在得到测序数据后，首先用FastQC软件对测序数据进行比对前的数据质控，来确认所有批次的测序数据质量是否稳定。然后再进行数据分析。
其中，最重要的是碱基质量值在reads上的分布图，以下图3-3为例，该数据将显著影响后面单核苷酸变异SNV检测结果的可靠性，以及后续所有流程中是否需要截除末端低质量值区域的判断。图中质量值为Phred分数，可以通过公式：
换算某个碱基位点的Phred分数Q以及发生测序错误的概率P，从图中可知，pair-end文库中的两侧reads的平均质量值均大于30，即错误率小于0.1%，可以认为测序的质量较好，在后续的信息学分析中仅需过滤其中极小部分的低质量reads即可，且这样的操作不影响整体的统计结果。
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