基于AI的蛋白质结构预测方法文献综述

 2021-12-28 20:35:32

全文总字数:2153字

文献综述

一、蛋白质结构预测问题蛋白质是维持生命所必需的大而复杂的分子。

几乎渗透到我们身体的每一个功能收缩肌肉,感知光线,或将食物转化为能量,都可以追溯到一种或多种蛋白质,以及它们是如何运动和变化的。

蛋白质的结构决定其功能,例如,构成我们免疫系统的抗体蛋白是Y形的,通过与病毒和细菌结合,抗体蛋白能够检测并标记致病微生物并进行消灭。

同样,胶原蛋白的形状像绳子,在软骨、韧带、骨骼和皮肤之间传递张力。

其他类型的蛋白质包括CRISPR和CAS9,它们的作用就像剪刀和切割和粘贴DNA;抗冻蛋白,其3D结构允许它们与冰晶结合并防止生物体冻结。

但是,纯粹从蛋白质的基因序列来确定蛋白质的三维形状是一项复杂的任务,是一项非常具有挑战性的任务,DNA只包含有关组成蛋白质的氨基酸残基序列的信息,氨基酸残基形成长链。

预测这些链折叠成的蛋白质复杂的3D结构就是所谓的蛋白质结构预测问题。

而预测蛋白质形状的能力对科学家很重要,因为它可以帮助理解蛋白质在体内的作用,很多疾病被认为是由错误折叠的蛋白质引起的疾病,如阿尔茨海默氏症、帕金森氏症、亨廷顿氏症和囊性纤维化。

同时预测蛋白质形状能提高我们对身体的认识和它的工作原理,使科学家能够设计新的,有效的治疗疾病的更有效的方法,在药物发现方面开辟了新的潜力,并且降低了与实验相关的成本。

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