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文献综述
一、简介 对酶功能进行准确的注释需依赖于基因组序列。
基因组序列注释是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究的一个热点。
基因组注释的主要内容是: 鉴定出基因组内的基因,确定基因的结构,推断出基因可能的功能,并预测相关的酶的功能。
最近被任命为ELIXIR核心数据资源的BRENDA是主要的酶和酶配体信息系统。
核心数据库提供了酶的全面概述,并将其数据内容与具有分析和可视化工具的复杂灵活的查询系统相结合。
二 意义随着微生物全基因组序列测定速率的加快,开发有Web 接口的高效、综合基因组注释系统十分必要。
另外随着基因组测序技术的不断发展以及测序成本的不断降低,越来越多的真核生物基因组能够被测序。
基因组测序是利用高通量测序技术对微生物的基因组进行测定。
与传统方法相比,基于高通量测序的基因组研究无需构建克隆文库,这避免了文库构建过程中利用宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差,简化了实验操作,提高了测序效率。
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