蛋白组学在呼吸系统疾病证候研究中的应用
摘要:蛋白组学是对机体、组织或细胞中全部蛋白质的表达量及蛋白质功能的研究方法。呼吸系统疾病多由遗传因素和环境因素多条件作用下产生,以蛋白质组为切入点,深入进行呼吸系统疾病的证候实质的研究,有利于从微观的角度动态地了解证候的物质基础,可为呼吸系统疾病证候辩证分型的客观化提供依据。
关键词:蛋白组学; 呼吸系统疾病; 中医证候.
一、文献综述
蛋白组学是对机体,组织或细胞中全部蛋白质的表达量及蛋白质功能的一种研究方法学。始于20世纪90年代,并与基因组学,生物信息学一起成为现代生物科学研究的前沿学科[1]。
呼吸系统疾病在由遗传因素和环境因素多种条件作用下产生,确诊及治疗都具有一定的困难,如肺结核、哮喘、肺癌及肺损伤等。呼吸系统疾病对个人,家庭以及社会都会带来极大的压力和经济负担。我国医学对呼吸系统疾病的治疗有着悠久的历史,中医治疗经验颇丰,对呼吸系统疾病治疗有一定的疗效,能够增加西医的治疗效果。而中医治疗的关键在于辩证施治,正确辨别证候是中医诊疗的关键。但由于目前中医辩证主要凭借经验,因此发现客观的呼吸系统疾病的证候标志物非常重要。蛋白质组学技术的很多特征如整体性、动态性、时空性、复杂性等与呼吸系统疾病证候的特点十分吻合,以蛋白质组为切入点,深入进行证候实质的研究,有利于从微观的角度动态地了解证候的物质基础,可为呼吸系统疾病证候诊断分型的客观化提供依据。现就蛋白组学技术在哮喘研究中的应用进展予以综述。
1.蛋白组学技术
蛋白组学技术中主要由蛋白分离标记技术、蛋白质分析鉴定技术和生物信息学分析组成。
蛋白组学中蛋白质的分离技术有利用蛋白质分子量和等电点不同来分离蛋白质的双向聚丙烯酰氨凝胶电泳(Two dimensional-polyacrylamide gel electrophoresis, 2D-PAGE)和双向荧光差异凝胶电泳(Bi-directional fluorescence differential gel electrophoresis, 2D-DIGE)等;而标记分离技术有以同位素标记并与液相色谱-串联质谱(Liquid chromatography tandem mass spectrometry, LC-MS/MS),同位素亲和标记((Isotope-coded affinity tag, ICAT)和细胞培养氨基酸稳定同位素标记(Stable isotope labeling with amino acids in cell culture, SILAC)等,也有稳定同位素标记蛋白组学技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, two-dimensional liquid chromatography, nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid QqTOF platform,iTRAQ-2DLC-MS/MS)[2,3]。蛋白质分析鉴定技术中的质谱技术是蛋白组学技术中不可或缺的一部分,常用的质谱技术包括:基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF-MS),表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laserdesorption/inionation-time of flight-mass spectra,SELDI-TOF-MS), 串联质谱等。蛋白组学质谱技术还在不断发展中,如四极杆串联飞行时间质谱(Quadrupole-time of flight mass spectrometry,Q-TOF)等[4]。
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