文献综述（或调研报告）：
SmallRNA v2.1分析流程包括：注释、新miRNA预测、靶基因预测、差异分析、富集分析等模块分析。
完成配置后，流程包括以下模块：过滤模块、基因组或转录组比对模块、miRBase数据库比对注释模块、GenBank数据库比对注释模块、Rfam数据库比对注释模块、外显子和内含子注释模块、repeat注释模块、piRNA数据库比对注释模块、miRNA数据库比对注释模块、mir2disease数据库比对注释模块、annotation 比对注释统计、新miRNA预测模块、差异分析模块、动物靶基因预测模块、植物靶基因预测模块、家族分析模块、聚类分析模块、功能分析模块。
使用到的软件有soap（2.20）、bowtie（0.12.8）、blast（2.2.23）、mirdeep（2.0.0.5）、mireap（动物0.2）、DEGseq（1.18.0）、DEseq（1.16.0）、RNAhybrid、miRanda（v3.3a）、TargetScan(fish_62)、PITA、TargetFinder（1.6）、psRobot（1.2）、goseq（1.16.1）、topGO（2.16.0）
最近的药理学和基因研究拓宽了影响攻击性的因素的范围，其中包括了神经传导物质、激素、细胞因子、酶、生长因子、信号分子等。攻击性的神经生理基础只有很少部分被人们所理解，因此本课题旨在研究这种复杂的行为。雄性暹罗斗鱼由于其好斗天性，容易被激怒，因此方便观察和比较其兴奋程度，适合做实验观察，而被选为研究好斗性、神经兴奋（或抑制）相关疾病的鱼类模型。
本课题利用斗鱼的特性，比较其发怒状态的转录组序列和静态基因组对攻击性、易怒性、好斗性进行研究。
引用
1. Nelson, R.J. amp; Chiavegatto, S. Molecular basis of aggression. Trends Neurosci 24, 713-9 (2001).
2. Miczek, K.A. et al. Neurobiology of escalated aggression and violence. J Neurosci 27, 11803-6 (2007).
3. Miczek, K.A., Fish, E.W., De Bold, J.F. amp; De Almeida, R.M. Social and neural determinants of aggressive behavior: pharmacotherapeutic targets at serotonin, dopamine and gamma-aminobutyric acid systems. Psychopharmacology (Berl) 163, 434-58 (2002).
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