理论研究一、题目简介CDK9是肿瘤发生发展过程中关键分子之一,而目前在研的CDK9抑制剂普遍临床抗肿瘤效果不佳。
本科题基于PROTACs策略构建CDK9小分子调控剂,以克服传统激酶抑制剂体内活性不佳的缺陷,以已有文献作为报道基础,对PROTACs分子的结构组成及作用机理进行调研。
二、拟研究或解决的问题本课题拟合成5个靶向CDK9的配体分子,以及5个募集E3泛素化酶的配体分子,最终通过引入不同长度、不同柔性的连接链合成10个靶向CDK9的PROTACs分子,通过Western Blot以及MTT实验分别检测化合物在肿瘤细胞中对CDK9蛋白的降解活性及抗肿瘤活性,基于活性结果进行初步构效关系总结,最终发现1~2较为优良的化合物。
对挑选出的化合物进一步通过初步的理化性质预测及测试评价,从而获得具有良好理化性质的、高活性的PROTACs分子作为靶向CDK9的抗肿瘤候选化合物。
三、采用的研究手段第一步:3-氟硝基苯在碱性条件下与高哌嗪反应 第二步:硝基还原为氨基四、检测(一)Western Blot检测化合物在肿瘤细胞中对CDK9蛋白的降解活性Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的方法。
对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。
与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,探针是抗体,显色用标记的二抗。
经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。
以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。
该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。
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