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1.代谢组学技术1.1代谢组学代谢组学是众多组学中的一种,是随着生命科学的发展而发展起来的。
与其他组学不同,代谢组学是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将其个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学。
所谓代谢组是基因组的下游产物也是最终产物,是一些参与生物体系新陈代谢、维持生物体正常功能和生长发育的小分子化合物的集合,主要是相对分子质量小于1000的内源性小分子 [1]。
1.2代谢组学的分析技术 代谢组学的研究过程一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。
首先,采集生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等),对其进行生物反应灭活、预处理。
再运用先进的分析手段如核磁共振、质谱或色谱等检测样品中所有代谢物的种类、含量、状态,从而得到原始的大量的反映生物样品信息的实验数据,而后使用多变量数据分析方法对获得的多维复杂数据进行降维和信息挖掘,从这些复杂大量的信息中筛选出最主要的最能反映代谢物变化的主要成分,再通过模式识别将其与标准的代谢物谱进行比对,或是根据代谢物谱在时程上的变化来寻找生物标记物,研究相关代谢物变化涉及的代谢途径和变化规律,以阐述生物体对相应刺激的响应机制。
同时由于不同分析手段各有其特点,在不同应用领域使用的分析方法也是有所不同的[2]。
代谢组学研究需要比较复杂的分离、鉴定方法,到目前为止,应用的方法主要包括NMR 、电喷雾电离质谱(electrosprary ionization mass spectrometry, ESI-MS) 、液相色谱-紫外光谱-质谱联用 (liquid chromatography ultraviolet mass spectrometry, LC-UV-MS) 、串联质谱 (tandem mass spectrometry, tandem MS) 以及液相色谱-质谱联用 (liquid chromatographymass spectrometry, LC-MS)等[3]。
在代谢组学的研究中,气相色谱-质谱 (GC-MS) 联用技术在植物代谢组学、诊断代谢组学、药物毒理等领域有广泛的应用。
有研究表明,采用GC-MS来检测大鼠尿样中内源性的代谢产物可以检测出49种,并且有26种代谢产物的检测可以达到定量标准。
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