LSD1 是一个黄素腺嘌呤二核苷酸(Flavin adenine dinulcleotide,FAD)依赖性胺氧化酶, 它能够特异性脱去单甲基化和二甲基化组蛋白H3第4位赖氨酸(H3K4)和H3K9位点上的甲基基团。
功能研究显示, LSD1定位于细胞核内,调控着基因转录的激活和抑制,被誉为细胞深处的基因开关,在胚胎发育和肿瘤发生过程中起着重要的作用。
组蛋白去甲基化酶LSD1的发现是表观遗传学领域的重要进展, 揭示了组蛋白赖氨酸甲基化和其他化学修饰如乙酰化、磷酸化、泛素化等一样是一个动态调节的过程。
结构和功能研究显示LSD1调控着基因转录的激活和抑制以及p53的活性, 在癌症的发生和发展中起着重要的作用, 是一个潜在的抗癌药物开发靶蛋白. LSD1又名KIAA0601、KDM1、AOF2、BHC110、p110b和NPAO,属于胺氧化酶家族成员,从酵母到人类均十分保守。
在LSD1的晶体结构中,有一个N端的SWIRM(Swi3p/Rsc8p/Moira)结构域,一个C端的胺氧化酶(Amine oxidase like, AOL)结构域,中心定位一个Tower 结构域(图1A)。
SWIRM结构域由6个螺旋和2个beta;折叠组成,该结构域的功能是作为蛋白-蛋白相互作用的基序。
Tower 结构域是C端胺氧化酶结构域向外伸出两条螺旋形成,把胺氧化酶结构域分成两个部分, 这一特殊结构对于LSD1的功能有着重要的作用。
LSD1的C端胺氧化酶结构域包括两个部分,FAD(Flavin adenine dinulcleotide)结合结构域和催化活性中心, 是组蛋白底物的结合位点。
在体外,LSD1可以与CoREST、BHC80、HDAC1/2等蛋白形成复合物。
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