文献综述
1文献综述1.1 基因组挖掘的研究方案1、基因组与转录组，深入挖掘基因表达信息一个物种基因组的成千上万基因各司其职，在不同组织、时期、环境下表达，从而能够翻译出对应不同生长需求或不同环境条件的蛋白，达到生长发育或应急响应等目的，基因的表达量常被用来定量评估基因的转录水平。
获得高质量的基因组，将使多倍体高重复等复杂物种的转录分析准确性更高，研究结果更具可靠性。
基因组结合转录组分析，使得基因功能研究不再仅仅依靠原来的RNA水平的研究，可以从基因序列结合变异信息和基因表达共同研究生物学问题，使问题研究更深入。
适用范围：特异性状根源基因挖掘、生长发育重要调控机理、多倍体优势亚基因组探寻等。
2、基因组与群体进化，解析物种发展历程动植物特定群体的个体基因组之间往往会存在大量变异，如单核苷酸变异、插入缺失变异、结构变异等。
自然群体区别于驯化栽培群体最大的特征是其丰富的遗传多样性，这些动植物往往经历了种群的扩张、传播、本地化适应、基因交流等长期驯化过程。
利用基因组水平遗传变异研究，可以更加准确和全面地解析动植物群体的系统发生关系及其结构、群体进化历史、遗传渐渗、驯化起源与人工选择位点情况。
该研究方案是目前广受高分基因组学相关期刊青睐之一的研究策略。
适用范围；不同群体分化历程探究、建立亚群间精确变异数据库1.2 基因挖掘在微生物方面的应用目前酶的来源变得多样化，在自然环境中表达和未表达的酶可以使用，只要能获得酶的基因，并且酶可以在实验室中表达。
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