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1.生物合成基因簇生物合成基因簇(biosynthetic gene clusters)BGC,是参与生产专门代谢产物的有组织基因群组。
一个BGC通常负责产生一种或者几种具有生物活性的相似化合物次级代谢产物：微生物生长到一定阶段才产生的化学结构十分复杂、对该生物无明显生理功能，或并非是微生物生长和繁殖所必要的物质，主要来源是放线菌、真菌等。
次级代谢产物的编码基因通常在基因组中成簇存在，编码具有多种功能的复合酶。
微生物次生代谢产物为开发新药提供了巨大潜力。
现在，基因组测序成本的快速下降使研究人员得以发现数百个甚至数千个编码这些化合物生物合成机制的基因簇。
2.生物合成基因簇的结构目前研究的比较清楚的有I型聚酮合酶(polyketide synthetase,PKS)和非核糖体肽合成酶(nontibosomal peptide synthetase,NRPS)等。
PKS和NRPS复合酶的基因主要是由连续的模块(Module)构成，每个基因模块的产物可催化多聚酮或多肽链的一轮延伸和可能的修饰。
一个基因可能含有多个模块，而模块并非最小单位。
次级单元:结构域(domain)。
一种次级代谢产物的合成由多个基因共同编码。
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