苦楝叶片转录组测序与SSR分子标记开发
1.1研究物种基本状况
苦楝正名为楝（Melia azedarach L.），是芸香目 Rutales芸香亚目 Rutineae楝科 Meliaceae楝亚科 Subfam. Melioideae楝族 Trib. Melieae楝属 Melia的一种植物。又名紫花树、苦辣树、楝枣子、楝枣树、花心树、洋花森、火棯树。苦楝属落叶乔木，高20m左右；树皮灰褐色有纵裂。2-3回奇数羽状复叶，卵形至披针形的小叶对生，叶基部略偏斜，叶缘钝锯齿状，顶生一片通常略大，幼叶被星状毛，后无；侧脉广展并向上斜，每边12-16条。圆锥花序约与叶等长；花气味芳香，花萼5深裂，5瓣淡紫色的倒卵状匙形花瓣；雄蕊管紫色，管口有10枚2-3齿裂的钻形狭裂片，内侧着生10枚花药；无毛子房近球形，有5-6室，每室2颗胚珠，花柱顶端具5齿，柱头头状，不伸出雄蕊管。球形至椭圆形核果，长1-2cm，宽8-15mm，内果皮木质，4-5室，每室1颗椭圆形种子。花期4-5月，果期10-11月。
苦楝是一种常见树种，产自我国黄河以南各省区，生于海拔低（700m以下，西南地区可在1900m以下）的路旁、疏林或旷野中，目前已广泛引种栽培。广布于热带和亚热带、温带地区，亚洲和大洋洲均有分布。
苦楝喜光，对土壤要求不严，耐干旱瘠薄，在酸性土至轻盐碱土上、石灰岩地区均能生长，但是在湿润肥沃的土地上栽植，才能保证树木生长迅速，适宜于在低海拔的平原区和丘陵区上造林，现在村边路旁种植的也很多。边材黄白色，心材黄色至红褐色，木材纹理粗而美，质轻软，有光泽和弹性，可制作家具乐器，作为农具杆柄材料，也可用作建筑舟车用材；叶子含有大量的次生化合物质，可用于灭钉螺和制作农药，果实、茎皮和根有毒，根皮可药用，驱除蛔虫、蛲虫和钩虫，根皮粉调醋可治疥癣；果实制作而成的油膏可治头癣，果核仁油也可用来做油漆、润滑油和肥皂的添加成分。
1.2 转录组测序概述
1.2.1 转录组测序简介
转录组(transcriptome)，狭义上是指通过转录表达生成的mRNA 的总和[8]；广义上是指在一定生理条件下，生命体细胞中转录本RNA 的集合，包括编码蛋白的mRNA，和不参与蛋白质的基因编码、但是在蛋白生成过程中占有不可或缺的位置的长链非编码RNA(long non-codingRNA，lncRNA)，如参与翻译蛋白质的tRNA，参与表达调控基因microRNA等[9]。
RNA-Seq (RNA-sequencing)也称为转录组测序，是最新发展起来的，利用新一代测序技术分析转录组的技术，全面快速地获得，特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本（包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA）的序列和表达信息，基因选择性剪接产生的不同转录本的表达丰度等。
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