石榴中Hsp20基因家族的鉴定与系统进化分析文献综述

 2022-04-10 22:12:12

文献综述

摘 要:基因家族是一类结构、功能具有一定相似性的基因。基于生物信息学方法,鉴定潜在家族成员,分析进化关系、基因结构、顺式作用元件等,预测基因功能以及在植物生长发育过程中的作用。Hsp20基因家族是一种古老、多样的基因家族。家族成员都包含alpha;晶状体蛋白域(alpha;-crystallin domain, ACD)结构。作为一种分子伴侣,参与植物的多种胁迫响应。许多物种中都鉴定出了Hsp20基因家族成员。石榴(Punica granatum L.)是一种落叶果树,性喜温畏寒,不适宜的生长环境是导致石榴产量、质量下降的主要因素。并未有人研究过石榴中Hsp20基因家族。本研究旨分析石榴中Hsp20基因家族,为提供高抗性石榴品种提供一定的理论依据。

关键词:Hsp20基因家族,分子伴侣,胁迫响应,石榴

1.1基因家族研究方法以及意义

基因家族来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复而产生两个或更多拷贝而构成的一组基因,同一家族中的成员有时紧密排列,成为一个基因簇,有时分散在不同的染色体上,有各自的调控模式。家族成员在结构和功能上具有明显的相似性,编码相似的蛋白质产物。Hsp20基因家族利用生物信息学的方法,从数据库中鉴定出潜在家庭成员,分析数据并可视化进化关系、基因结构、顺式作用元件、motif等,为预测家族基因在生长发育过程中的作用、物种间的进化关系的提供依据,给科研工作者开展育种、物种分类等相关研究一定的理论指导。

1.2 Hsp20基因家族简介

小分子热激蛋白(small heat shock protein,Hsp20)是一类从细菌到高等真核生物体内普遍存在的古老蛋白质家族。Hsp20基因家族成员蛋白质包含alpha;晶状体蛋白域 (alpha;-crystallin domain, ACD)结构,又称Hsp20结构域。该结构域的特征是以带有beta;-sandwich结构的低聚物的形式来形成一个空心球[1] 1。在胁迫环境下,植物体内的蛋白质聚集导致蛋白质结构不可逆破坏从而导致功能的丧失。Hsp20蛋白质作为一种分子伴侣,胁迫环境下,结合非折叠蛋白质,从而阻止非折叠蛋白质不可逆聚合,使其保持正确折叠,正常行使功能。

1.3 Hsp20基因家族研究进展

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