LcPIN1启动子的克隆和分析文献综述

 2022-06-30 23:05:31

文献综述

生长素一直是植物学研究的热点,研究内容包括生长素的生物合成、生长素的运输、生长素的信号通路以及生长素与其他激素的相互作用。极性运输是生长素的重要特征,作为外输载体的PIN蛋白家族自然成为了研究重点之一,其中,PIN1蛋白在植物发育过程中具有重要作用,参与到胚的发育、叶脉和叶序的形成、生长素的运输等过程。研究PIN1启动子对于基因表达调控机制的研究具有重要的意义,

1 启动子简介

1.1 启动子的概念

启动子是一段能被RNA聚合酶特异性识别并结合,从而能够正确有效的开始转录的一段DNA序列。启动子一般位于基因5rsquo;端上游区域,长度约为200bp[1],原核生物只有1种RNA聚合酶,而真核生物启动子有3类,分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。

1.2 启动子的结构

Ⅰ型和Ⅲ型启动子位于转录起始位点的上游,结构相对简单,高等植物的启动子属于Ⅱ型启动子,结构较为复杂,一般由核心元件和上游元件组成[2]。

核心元件包括转录起始位置附近的起始子和TATA框。起始子(initiator)是位于转录起点附近的一个保守序列,一般由Py2CAPy5构成,位于-3~ 5处,可能提供RNA聚合酶Ⅱ识别,DNA在此处解开并开始转录[3]。TATA框(Goldberg-Hogness)是转录起点上游一段富含A-T碱基对的保守序列,一般位于转录起始点上游约-26~-34bp处[4]。其作用之一就是确定正确的转录起始位点,RNA聚合酶Ⅱ与TATA框牢固结合之后才能开始转录,保证转录的精确性,当TATA框缺失后,可能会引起转录起始位置的改变[5]。当然,有的基因天生没有TATA框,可能由起始子代替它的作用,例如鼠的脱氨核苷转移酶(Tdt)基因就没有TATA框,但有17bp的起始子。TATA框的另一个作用是影响转录速率,当序列发生改变后会影响与酶的结合能力,最终影响转运效率,例如地中海贫血症就是人的beta;珠蛋白基因的ATAAA序列突变造成珠蛋白肽链合成障碍所导致的疾病。

上游元件包括包括CAAT框、GC框等。CAAT框的保守序列是GGCTCAATCT,位于转录起始点上游约-80bp处,是转录因子CTF/NF-1的结合位点,控制着转录起始的频率,但其也能够在离起始点较远的距离仍能起作用,并且正反方向排列均可发挥作用。此外,CAAT框的突变对启动子的特异性没有影响[6]。GC框的保守序列为GTGGGCGGGGCAAT,一般位于转录起始点上游-90bp附近,也可位于TATA框和CAAT框之间[7],经常以多拷贝的形式存在。它的作用也是控制转录效率。

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